数码显微镜(英文：Digital microscope或Computer microscope)又叫数字显微镜、照相显微镜、摄像显微镜或是CCD显微镜等众多不同的叫法，但是无论哪种说法，都实质上是表达同一个意思。是将精锐的光学显微镜技术、先进的光电转换技术、液晶屏幕技术完美地结合在一起而开发研制成功的一项高科技产品。它是将显微镜看到的实物图像通过数模转换，使其成像在计算机上。从而，我们可以对微观领域的研究从传统的普通的双眼观察到通过显示器上再现，从而提高了工作效率。

    数码显微镜根据数据显示方式不同可分为两大类：自带屏幕数码显微镜和采用计算机显示的数码显微镜。
    自带屏幕数码显微镜，又可分为三类：
    1、台式数码显微镜；
    2、便携式数码显微镜；
    3、无线数码显微镜。
    台式数码显微镜的主要特点是放大倍率相对较高，可以与电子显微镜媲美；便携式数码显微镜追求的是随处可显微，讲究小巧。
采用计算机显示的数码显微镜通过显微镜内置的摄像机将显微镜看到的标本图像传输到计算机上，通过计算机上安装的显微图像分析软件进行追踪分析，从而获得一系列有价值的定性定量数据。主要用于微生物鉴定、细胞形态检查、尿液有形成份分析、纤维细度检测等方面。具有全自动扫描、图像分析功能强、拓展性强等诸多特点。
    另外，现时市面有部份数码显微镜可以让用户从底座拿起，直接对准观察物，被称作手持式数码显微镜。在教学上，教师可以即时利用身边的事物来作显微镜的讲解事项。举例说：教师可以透过手动调校目镜与观测物的距离来把观测物放大，而这些观测物可以是学生的手掌、头发、甚或口腔、牙齿。这样的仪器在观念上是一项突破：过去观察物要迁就显微镜，现在显微镜可以迁就观察物。因为这项改变，使得使用者可以在几乎任何时间、任何地点观察微小的事物。除了以上所述的教学使用方面，近来手持式数码显微镜也被广泛运用在田野调查(Field Study)，以及产业方面的运用。

    数码显微镜在观察物体时能产生正立的三维空间影像。立体感强，成像清晰和宽阔，又具有长工作距离，并是适用范围非常广泛的常规显微镜。它操作方便、直观、检定效率高。

    数码显微镜与普通显微镜之间的不同，有下面的六大区别：
    1、具有显微摄像功能，把观察到的显微效果保存下来，形成图文文件，可给相关部门互相传阅；普通显微镜只能通过目镜观察，不能进行显微摄像。
    2、与电脑相接，可以实现多人同时观察；普通显微镜只能一人观察。
    3、通过电脑屏幕预览，可以减少眼睛疲劳；普通显微镜则需要每时每刻通过目镜观察，容易造成眼睛过度疲劳。
    4、数码显微镜的成像装置可以有测量，打印图文报告，录像等功能；普通显微镜只能单纯的进行显微观察。
    5、数码显微镜是现代科学仪器仪表发展的一个新时代，具有很多普通显微镜没有的功能。它在科学研究、产品检测、教学演示、考古等方面都有迅速的发展。