染色质结构的调节在真核细胞的转录调节中起着关键作用。核小体由四个核心组蛋白（H2A、H2B、H3 和 H4）组成，它是染色质的主要成分。除了使用大量调节染色质结构的翻译后组蛋白修饰外，细胞还能用组蛋白变体交换典型组蛋白，从而直接或间接地调控染色质结构 (1)。组蛋白 H2A 有五种主要变体：标准 H2A（数量最多）、H2A.X、MacroH2A、H2ABbd 和 H2A.Z（2）。组蛋白 H2A.Z 是物种中最保守的一种变体，可同时作为转录的正负调节分子，并且对染色质稳定性非常重要 (2)。多种同源性蛋白复合体可催化核小体中 H2A.Z 与 H2A 之间的 ATP 依赖性互换，这些复合体包括 SWR-C（酿酒酵母）、TIP60（果蝇）和 SRCAP（哺乳动物）(3,4,5)。这种组蛋白 H2A 变体的互换会改变核小体核心中组蛋白之间的相互作用，修改核小体表面的酸性补丁，从而改变核小体稳定性及与非组蛋白（如 HP1α）的结合 (6,7)。
H2A.Z 是一种对基因表达的正常调控非常关键的组蛋白 H2A 变体蛋白。H2A.Z 位于基因组中，但似乎最集中在活性基因的启动子和增强子 (8)。组蛋白 H2A.Z 在启动子和增强子上被乙酰化会使核小体变得不稳定，并导致染色质确认保持开放状态，因此促进转录激活 (9-11)。虽然大部分组蛋白 H2A.Z 似乎被排除在组成型异染色质之外，但组蛋白 H2A.Z 被发现存在于各种形式的兼性异染色质中，包括失活的 X 染色体和准备转录的二价基因启动子 (8,12)。在基因组的这些异染色质区域，H2A.Z 在 Lys120 和 Lys121 上被在多梳阻遏蛋白复合体 1 (PRC1) 中发现的 Ring1B 泛素连接酶单泛素化 (8,12)。H2A.Z 在 Lys120 和 Lys121 上被单甲基化会抑制激活 BRD4 蛋白的结合，并促进多梳阻遏蛋白复合体 2 (PRC2) 的募集（这会在 Lys27 甲基化组蛋白 H3 并促进转录抑制），从而抑制基因表达 (8)。