一文读懂原核蛋白表达
作者:卡梅德生物 2024.09.03 点击1527次
1.原核表达概念 蛋白表达是指用模式生物如细菌、酵母、动物细胞或者植物细胞表达外源基因蛋白的一种分子生物学技术。原核蛋白表达是指通过基因克隆技术,将外源目的基因,通过构建表达载体并导入表达菌株的方法,使其在特定原核生物或细胞内表达。
2.原核蛋白表达系统优缺点 常见的蛋白表达系统有原核、酵母、昆虫、植物和哺乳动物表达系统,其中最经济最实惠的是原核蛋白表达系统,四种常见表达系统区别如下表1:
表1:常见蛋白表达系统区别
蛋白表达量:原核>酵母>哺乳,昆虫系统与原核和酵母接近,选择合适的蛋白表达系统还需要根据您的实验成本、周期等一系列因素综合考量,目前最常用的是原核蛋白表达系统,原核表达体系常用的宿主为大肠杆菌和枯草杆菌,前者表达量高,后期产品需要去除内毒素;后者蛋白产量相对较低,但不产生内毒素,主要区别如下图所示:
3.原核蛋白表达系统组成 一个完整的蛋白表达系统通常包括宿主、外源基因、载体和辅助成分组成的体系。 3.1宿主菌 原核蛋白常见宿主菌系列为BL21(DE3)、Rosetta系列菌株。 3.2外源基因 由于外源基因具有多样性,高效表达外源基因须考虑优化密码子,提高外源基因 mRNA 的稳定性,优化载体设计等。 3.3表达载体 原核蛋白表达载体质粒包括复制子(Replicon)、启动子(promoter)、筛选标签(selection marker)、多克隆位点(MCS)和融合蛋白移除策略(fusion tag removal strategy),常见的原核表达载体pET-28a(+)、pGEX-4T-1、pET SUMO。 3.4其他组成(融合标签) 蛋白重组表达过程中采用亲和标签融合表达有两方面的作用:一方面是为了使蛋白纯化过程变得更加容易;另一方面是为了促进某些不溶性蛋白可溶。融合标签选择可参考卡梅德官网列表。 4.原核蛋白表达系统应用方向 原核表达系统有非常良好的应用前景。根据查询相关公开信息显示,原核表达系统可以用于大规模生产重组蛋白,如药物、疫苗、抗体等,从而为生物医学领域提供了有力的支持,原核表达系统可以用于生产植物和动物的生长调节物质、抗菌肽、抗虫蛋白等,从而提高作物产量和品质,降低农药使用量,保障食品安全。同时,原核表达系统也可以用于生产工业酶、生物染料等,具有高效、低成本、环保等优点,为工业生产提供了新的途径。 5.原核蛋白表达全流程介绍 5.1优化密码子 大肠杆菌对密码子的使用频率不同,有最佳密码子,偏好密码子,一般选择使用频率大于20%的密码子。基因序列经过优化,能提高mRNA二级结构的稳定性,避免tRNA库数量不充足延迟/终止翻译,翻译移码和氨基酸错配等情况。 5.2目的基因合成 通过PCR方法,以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段。 5.3表达载体构建 选择合适的载体,常见原核表达载体是pET系列、pGEX-4T-1、pET-SUMO等,将表达质粒用限制性内切酶(同引物的酶切位点)进行双酶切,酶切产物行琼脂糖电泳,PCR产物双酶切后回收。 5.4转化表达菌株 原核蛋白使用BL21(DE3)、Rosetta系列菌株,将质粒载体在连接酶作用下转化到RosseStta BL21菌株,通过涂布TB(含50ug/ml kana)平板筛选,挑取单克隆进行活化培养。 5.5蛋白表达鉴定 从TB平板中挑取单克隆活化培养至菌体OD600为0.6-0.8时,IPTG进行37℃诱导4h表达,取诱导表达前与诱导后各条件的菌体制样进行SDS-PAGE分析。
5.6蛋白放大表达与纯化 5.6.1放大表达 取能够表达目的蛋白的BL21菌株,接种到1L TB培养基,加入IPTG诱导12h,离心,收集菌泥,超声破碎后收集上清和沉淀。
5.6.2纯化 上清纯化:过滤膜上Ni柱亲和富集纯化,SDS-PAGE分析。 包涵体(沉淀)纯化:缓冲液洗脱上Ni柱亲和富集纯化,SDS-PAGE分析。 5.7交付 SDS-PAGE结果图片。 | 产品分类
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